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PRODUCTS

片段分选试剂盒;DNA-select Kit

可广泛应用于各类基因测序文库构建过程中的DNA片段分选,以及PCR产物净化。

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DSS-010
DNA-select Kit
10mL
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<5天
DSS-100
DNA-select Kit
100mL
询价
<5天
DSS-500
DNA-select Kit
500mL
询价
<5天
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产品描述

      基于澳门新葡平台网址8883生化科技多年自主研发生物纳米磁珠技术和丰富的DNA提取纯化技术,采用固相可逆结合(Solid-Phase Reversible Immobilization)原理,通过超顺磁性纳米磁珠和结合缓冲液的优化组合,成功开发了EnrichingBeads ® DNA-select Kit片段分选试剂盒。

      本产品可广泛应用于各类基因测序文库构建过程中的DNA片段分选,以及PCR产物净化。


产品特点

* DNA片段分选

本产品应用于DNA片段分选时,可选择特定比例的磁珠结合液用量,获得不同片段范围的DNA;能够回收到的低DNA片段大小与所用(相对于样本体积)的试剂比例呈负相关。

包括:左侧分选——获取 大于目标长度的DNA片段

右侧分选——获取 100bp-目标长度的DNA片段

双向片段分选——获取 目标范围DNA片段

* PCR产物净化

本产品应用于酶促反应产物中DNA纯化时,可高效回收≥100bp的DNA,有效去除dNTP、引物二聚体、盐类、蛋白质和其它杂质。

*适合高通量

本产品既适合于手动操作,也可应用于基于自动化移液工作站的高通量文库构建工作。

* 替代简单

本产品同进口主流产品Beckman AMPure XP、GE Sera-Mag等具有相同的操作流程,无需任何条件摸索,可直接完成替代。

产品应用   

模式

描述

分选片段上限

分选片段下限

左侧分选

Left Sided Selection

保留大于目标长度的DNA片段

使用特定比例用量的磁珠结合液,回收大于目标长度下限值的DNA片段

100bp的变量

右侧分选

Right Sided Selection

保留100bp - 目标长度的DNA片段

通过两轮磁珠分选,回收小于特定长度上限值的DNA片段,即:

第一轮分选,结合并丢弃大于特定长度上限值的DNA片段;

第二轮分选,结合并回收上清液中剩余的≥100bpDNA片段。

>100bp的变量

≈100bp

双向片段分选

(多用于NGS文库制备)

Dual Size Selection

保留目标范围DNA片段

通过两轮磁珠分选,回收特定长度范围内的DNA片段,即:

第一轮分选,结合并丢弃大于特定长度上限值的DNA片段;

第二轮分选,结合并回收上清液中大于另一特定长度下限值的所有DNA片段。

变量

>100bp的变量

PCR产物净化

PCR Clean-up

去除dNTP、引物二聚体、盐类、蛋白质和其它杂质

使用大比例的磁珠结合液量,回收≥100bpDNA片段

≈100bp


图1:片段分选-左侧分选流程示意图[[1]]


图2:EnrichingBeads ® DNA-select Kit左侧分选和右侧分选效果图

图3:片段分选-右侧分选流程示意图[[2]]


图4:  EnrichingBeads ® DNA-select Kit片段分选实际工作图谱(使用仪器:Agilent4200 TapeStation System)

图5: EnrichingBeads ® DNA-select Kit片段分选实际工作图谱(使用仪器: Agilent 4200 TapeStation System



[1] 示意图源引自BECKMAN COULTER SPRIselect User Guide

[2] 示意图源引自BECKMAN COULTER SPRIselect User Guide






  • 不用调整程序,可以完全直接替代。 尽管如此,考虑到流程的稳定性,我们建议在更换之前还是完成对照实验为宜。
  • EnrichingBeads ® DNA-select Kit能够结合大片段全基因组,但是不建议用于纯化提取全基因组,尤其是对于非常大的DNA片段,该试剂盒所选用的磁珠对于大片段的DNA结合力较强,并且在结合大片段DNA时容易引起磁珠团聚,造成洗脱困难。
  • 琼脂糖凝胶电泳鉴定纯化效果和计算回收率,要向获得更准确的结果建议使用Agilent2100等仪器。不建议使用Nanodrop等仪器通过吸光度来计算回收率,因为溶液中的ssDNA、dsDNA、dNTP和其他杂质在260nm处均有光吸收,会影响测量和计算的准确度。
  • 1)EnrichingBeads ® DNA-select Kit对相同长度的dsDNA和ssDNA效果相同; 2)可用于纯化和提取gDNA,但磁珠干燥后gDNA后不易洗脱,需注意除醇挥发时间,同时,加热洗脱有助于提高洗脱效率; 3)EnrichingBeads ® DNA-select Kit原理上均可适用于DNA和RNA,但本试剂未进行RNase灭活处理,不可用于RNA。
  • 1) 包括EnrichingBeads ® DNA-select Kit在内,所有的磁珠法DNA分选试剂盒均不是一刀切,在50-100bp间会有少量核酸残留,若需尽量减少<100bp的片段存在,可以使用1.5X(甚至1.2X)而不是1.8X进行纯化; 2)样品中含有乙醇、PEG、MgCl2等物质会导致磁珠吸附更小的片段,但分子克隆中酶促反应的正常MgCl2用量对其无影响。
  • 产物回收量由三个因素决定,即结合、清洗和洗脱。在操作中确保: 1)磁珠充分重悬均匀,且恢复室温; 2)80%乙醇需要新鲜配置; 3)清洗时勿扰动磁珠; 4)乙醇挥发时间适中; 5)洗脱体积不能过低; 6)磁吸效果和避免磁珠损失。

【技术资料】

【技术视频】

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